序幕 博物館之迷
博物館的大廳內，同學們被聞名遐邇的敦煌文化藝術展所震撼﹔游覽中，一位小女孩被這塞外大漠中的藝術珍寶深深吸引，放緩了腳步，不知不覺中走進了一間未開放的展廳﹔她站在了一幅名為《九色鹿》的壁畫前，驚嘆著壁畫的精美和畫中描繪的故事，那新奇的色彩與線條讓畫中的世界栩栩如生，而想象的翅膀更讓她置身畫中：
“九色鹿在暴風雪中普救眾生，耍蛇人背信棄義引起眾怒，神鹿不計前嫌跳澗救人……”看到這驚險時刻，小女孩情不自禁地一聲疾呼，誰知，竟驚動了壁畫中的人物﹔畫裡畫外因這回蕩於空中的疾呼出現了神奇的聯接，讓小女孩不知所措，更在緩緩走出壁畫的九色鹿的引領下，走進了畫中美麗而奇幻的世界。
第一幕 繁華市集
跨過一道光之門，小女孩來到了絲綢之路上的漠北古城，繁華市集上的商販叫賣、好客村民的熱情款待不禁讓她著迷，更有雲游商人送給她一件美麗的寶裙，讓小女孩變成了一隻五彩斑斕的妙音鳥……
大家彈唱舞蹈正盡情狂歡，突然狂風大作、漫天風雪扑面而來。在眾人生命危在旦夕之時，一道七彩霞光從天而降，原來是九色鹿以神力擋住了風雪，拯救了城中百姓，更救起了險些淹死在河中的耍蛇人。
蘇醒後的耍蛇人對天起誓，說他要做九色鹿最忠誠的仆人﹔神鹿婉拒了他的誓言並提醒眾人萬萬不可透露它的行蹤﹔隨後，在眾人感恩的目光中，九色鹿帶著小女孩變成的妙音鳥奔向了遠方。
不久，耍蛇人看到了懸賞捕捉九色鹿的布告，布告上說王後夢見了美麗的九色鹿，如果誰能捉到九色鹿把它獻給王後，就可以得到一大筆豐厚的賞金。金子閃爍出的光芒、錢幣叮當的清脆美妙誘惑著耍蛇人揭下了布告，邁步向王宮走去。
第二幕 神鹿秘境
耍蛇人帶領著大批兵馬前去捉捕並包圍了九色鹿，神鹿輕輕一躍站在了山頂。它質問耍蛇人為什麼要背信棄義，它向眾人講述與耍蛇人的過往，而耍蛇人那番錚錚誓言彷佛還回蕩在耳邊。眾人恍然大悟，國王、王後、眾武士倍感慚愧，紛紛放下刀槍，同時向耍蛇人投去憤怒的目光。
惱羞成怒的耍蛇人眼看著即將到手的賞金財寶化為泡影，而自己的貪財之心又被當眾識破，邪念頓時涌上心頭，他拿起尖刀奔向九色鹿，匆忙中卻因躲避飛來保護神鹿的妙音鳥而失足掉下山澗。
眾人驚呼之時，九色鹿毅然隨之地跳下山澗……忽然間祥雲涌現、霞光萬丈，九色鹿馱負一人而出，它再次救了耍蛇人的性命。
耍蛇人羞愧難當、懊悔不已，在山頂的明燈前長跪不起……
尾聲
恍惚間妙音鳥變回了小女孩，空中傳來了九色鹿悠然的聲音：“你要回去了吧！再好好看看這綺麗玄妙的美麗世界吧！永遠，別忘了我們。”伴著九色鹿與畫中眾人在小女孩面前漸漸遠去。回到現實中的小女孩仍對這番神奇的游歷與震撼而久久不能平靜﹔她感受到了這大漠風沙掩映下永恆不竭的燦爛文明，或許正是這流傳千年的文明，才孕育出了讓人感動與堅守的信之根、義之源！
黎明的鐘聲敲響了，吉賽爾和幽靈們消逝了。阿爾貝特心裡無限悲傷，從此，他失去了一位少女純潔、堅貞的愛。
